En un futuro cercano, las computadoras no serán lo que conocemos hoy en día, estas vendrán hechas justo a la medida, con nuevas funciones sorprendentes y lo mejor, con forma de humanos. Estas serán las Persocon, computadoras que cumplen tareas parecidas a las de las actuales, navegar por Internet, recibir llamadas, leer correos, jugar en linea, pero cuya apariencia es igual a la de las demás personas exceptuando por algunos detalles.
Dentro de este panorama, aparece Hideki Motosuwa, un chico proveniente del campo, que llega a la gran ciudad para preparase y así poder presentar su examen de ingreso a la Universidad. Un día, por casualidad, encuentra una Persocon muy bonita entre la basura, por lo que se emociona mucho. Al comienzo no sabe cómo usarla, ni para que sirve, pero en el camino se va encontrando personas que lo ayudan, entre ellos Shimbo y Minoru, que luego descubren que posiblemente Chii corresponde a una serie de Persocons legendarias con habiliades excepcionales llamadas Chobits.
